但非常可惜的是，杨肇基于崇祯四年的仲春初九日病逝于蓟州镇三屯营，享年五十一岁。
至于黑云龙为何会成为总督标虎帐参将，这个天然是因为黑云龙在共同孙承宗围歼那些通敌卖国的将领及晋商时立下了大功，厥后又在对鄂尔多斯与逃至河套一带的虎墩兔作战中立有大功，终究成了孙承宗的总督标虎帐参将，并在孙承宗调离宣大前去兰州时，他挑选了一同前去。